Sakura, princesse de Clow, est secrètement amoureuse de Shaolan, un jeune archéologue. Shaolan a repris le travail entamé par son père, des années plus tôt.
En explorant les ruines du pays de Clow, accompagné de Sakura, ils tombent sur un mystérieux blason. Au méme moment, ils subissent une attaque des ennemis du royaume qui déclenche également une force issu du blason. La puissance étrange qui s'en libére, entraîne la perte de la mémoire de Sakura, et les plumes qui symbolisent son âme sont dispersées à travers plusieurs dimensions. Désespéré, Shaolan jure de tout faire pour aider Sakura.
Il va ainsi voyager de dimension en dimension pour retrouver les différentes plumes.
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